هذه العملية تشبه عملية التعقيم بأجهزة الأوتوكلاف.
تستوجب تلك الطريقة تقطيع وفرم النفايات إلى أجزاء صغيرة داخل غرفة المعالجة، ثم تعامل بسيل وافر من موجات الميكروويف على درجة حرارة عالية درجة التعقيم ، والتي يمكن توفيرها بدفع بخار ساخن في الغرفة أثناء المعالجة.
والتلوث المقبول هو درجة من درجات التلوث التي لا يتأثر بها توازن النظام الإيكولوجي ولا يكون مصحوبا بأي أخطار أو مشاكل بيئية رئيسية.
هذا ويجب التخلص من النفايات الصلبة المنزلية بسرعة وذلك لوجود مواد عضوية تتعفن بسرعة ، وتتصاعد منها روائح كريهة ، وتسبب تكاثر الحشرات والقوارض.
في الوقت الحاضر يستخدم التطهير الكيميائي أيضا لمعالجة النفايات الطبية.
يجب عدم التخلص من النفايات الطبية في المكبات المفتوحة أو بالقرب منها.