التطورات في مرحلة الدراسات العليا تم إضافة برنامج الدراسات العليا لطلبة العلوم في المرحلة الثالثة من تطوير الجامعة.
كما كان هذا التطور هو الهدف الأول والأخير الذي مكن الطالب من التوسع والتنقل في العديد من علوم الإسلام وتوسيع مداركه والقدرة على القيام بالعديد من الدراسات والأبحاث المختلفة ليتمكن من نشر الدين إسلامي بسرعة.
إن الخدمات الذاتية للجامعة عبارة عن خدمة إلكترونية تقدم لفائدة الطلاب والطالبات الذى تم تسجيلهم على بوابة الجامعة للإستفادة من الخدمات التى تقدم بشكل إلكتروني.
جامعة الإمام محمد بن سعود الخدمات الذاتية أتاحت جامعة الإمام محمد بن سعود الخدمات الذاتية لطلابها الأعزاء، والتي تمكن جميع الطلاب المنتسبين للجامعة، حيث يستطيع الطلاب تسجيل الدخول، وبالتالي فإنها تمكنهم من التعرف على جميع المقررات الخاصة بهم، وهي أحد الخدمات الذاتية التي تقدمها عمادة شؤون القبول والتسجيل، وتمكن الطلاب من التقديم على المعاملات الأكاديمية بواسطة الخدمات الذاتية لطلاب وطالبات الانتظام، والتي تتضمن طلب إعادة القيد، والفرص الاستثنائية للفصول الدراسية.
كما تضم جامعة الامام محمد بن سعود كليات مختلفة من علوم الشريعة الإسلامية وعلوم السنة النبوية والمعتقدات والمذاهب المعاصرة واللغة العربية والدعوة إلى الله والحضارة الإسلامية وتاريخها.
جاء قرار فتح فروع وكليات جديدة تلبية لرغبة جميع طلبة العلوم في الالتحاق بالجامعة سواء التحاقهم بمعاهد أو كليات مما أدى إلى توفير مسافات للطلاب الراغبين في دراسة فرع معين وتطلب منهم السفر لمسافات طويلة وغربة، ولم تكن الكليات كلها في نفس المنطقة، بل افتتحت كليات في أماكن بعيدة عن الجامعات إلى حد ما، مثل القصيم والأحساء والمدينة المنورة.